考えられる原因は下記となります。
サブスクリプショングループに紐付けしている商品で在庫切れ・下書きステータス・アーカイブの商品がある
Shopifyディスカウント設定で「商品の割引」クーポンを発行し、お客様が利用している場合
対象のサブスクリプショングループの紐付けしている商品が0個
ストア側やマイページにある「商品追加」を実行し、ボックスの商品を削除してしまった場合
など